26.5ghz的ka波段卫星，带宽90mbps，下行速率最高11.25m\/s。110号掩体里的地面站，在过去的的14天里，已连续接收了300多g的数据。解码后，显示为11个人连续14天的基因组数据。
按照日志里的说法，还有4个人的数据仍在传输。
不过目前的这些，已经足够了。
虽然那份日志让人看了之后抑郁到吃不下饭，所谓的“绿疸”病也十分骇人听闻。但在卢赫看来，这些都不重要，毕竟他们的手再长也伸不到一万多公里外的德克萨斯州去。
真正重要的在于那些“绿疸”病人的基因组数据。
一直以来，之所以他们都无法定位导致海老头生病的关键突变，是因为他病得太花里胡哨了。许多病症并没有经过表观学研究，根本没人知道那些莫名其妙的突变对应着什么样的症状。
而日志主人的重病和死亡与“绿疸”绝对相关，“绿疸”又是叶绿素，叶绿素不是人应该拥有的东西，表达它的基因位点很容易定位。
目前所得到的11份数据中有6位健康，5位重病或死亡，这是天然的对照组，他们只要对比叶绿素位点附近的基因段来寻找死亡原因就好了。
海昼天那300多pb的垃圾，不敌莫妮卡的300多gb。还真是可怜。
卢赫感慨着回到办公区，把任务布置下去。几小时后，在场的所有人都开始欢呼着抛馒头。
卢赫也抛了。抛东西是一种释放情绪的方式，可以让人感受到快乐和兴奋。比如婚礼上抛鲜花、运动比赛上抛帽子、节日庆典中抛彩带，这都很正常。无非就是馒头抛完了还要捡回去吃。
人们集体生病的原因找到了。无论是得小病的一般人，还是得大病的海昼天，还是病死了的莫妮卡，原因都在于转座。
九死还魂草没死是因为转座、蓝藻光合作用大幅提高是因为转座、裸鼹鼠长寿不得癌也是因为转座。结局早已写好，线索也数次浮上水面，只是刚刚被有心之人探寻到。
复习一下，转座子是一段不被表达的遗传物质，但却可以被复制和剪切，然后插入到其它基因位点上，调控其它基因的表达。
转座子有两类，一类叫做‘反转座子’，先转录为rna，然后rna再逆转录为dna，插入到特定的位点，是复制粘贴。
另外一类叫做‘dna转座子’，不复制自己，而是直接移位，是剪切粘贴。
这两种都是常见的转座过程。
通过对比“绿疸”病患者的基因发现，相比仍旧健康的患者，重病或死亡的患者存在逆转录转座子的异常激活。那些长达100-5kbp的大剪子，被扰了清梦，格外暴躁地在基因链上胡乱蹿腾，剪开链条，把自己插进去。一旦插到关键的基因片段上，引发致命突变，人就会迅速生病。
至于为什么因转座致病的病人最终可以康复，是因为当突变基因的拷贝量不是很高的时候，细胞在执行新的拷贝时，可以通过同源重组的方式修复异常的基因。只要在这期间，病人还活着。
至于为什么会有转座子异常激活，初步猜测这是生物的一种防护机制。虽然基因突变是物种进化的第一推动力，但绝大多数的基因突变都是不利于生物的生长发育和生存的。
所以生物进化出了多种dna损伤修复机制，包括直接修复、切除修复、重组修复、错配修复等等，防止偶然的dna损伤被转化为永久的突变。
而转座过程修复突变基因是一种完全颠覆性的观点，因为在以往，转座本身就是一种导致基因突变的重要原因之一。但这一次，卢赫他们看到有一部分过分活跃的转座子靶向地出现在了接口和超长外源基因片段上。
它们挥舞着大剪刀狠狠地把这些妖魔鬼怪切开，把自己插入其间，让这些外来的吸血鬼失效，不管它们究竟起了什么作用。家里睡了个陌生人，不论是好人还是坏人，不管三七二十一先嘎了再说。
这本是一套绝妙的防御机制，可也许那些在45亿年间都未曾见过的接口和外源基因过于强大，以至于让它们出现应激反应。
它们不光把陌生人嘎了，顺带着把长得像陌生人的家人也都给嘎了。它们会把自己插入正常的基因片段中，引起不必要的突变，让人生病。
至于为什么有的人不生病，是因为反转座过程可以被多种途径调控，道高一尺魔高一丈，转座子和转座子的监管者始终在进行博弈。
许多因素可以发挥监管作用，比如rna编辑酶apobec家族、na解旋酶mov10、同源重组修复因子brca1等等，它们在历史的长河里，始终与转录转座子共同进化，无时无刻不在进行军备竞赛，谁也不让谁。
更直接的，反转座过程还可以被一种dna甲基转移酶（dnmt1）全局调控，dnmt1水平高的人，转座子会始终处于沉默状态。他们不会触发上述那套离奇的防御机制，也就始终不会因此生病。
至于为什么198号鼠爵及其孩子的基因格外稳定，始终未见类似的过程，初步猜测是因为世代遗传使它们身上发生了选择性清除。
选择性清除指的是，当一个有利突变发生后，这个突变基因的适合度越高，越有利于生存，就越容易被选择固定。
当突变基因被快速固定之后，与此基因座连锁的染色体区域，由于搭车效应也被固定下来，大片紧密连锁的染色体区域因此失去多态性，与突变相冲突的基因会被清除。
这种机制可以完美地解释为什么众多鼠海豚中，只有江豚一种可以在淡水中安然生活。
最初某一群江豚体内与肾功能相关的蛋白基因发生变异，可以在淡水中生存。
之后，淡水中活着的江豚彼此结合，发生选择性清除，与肾功能相关的遗传多样性丧失，繁衍多代后，突变被固定，子代全部可以在淡水中生活。
也许，在赛格兰最初改造的大批老鼠中，只有几只因为各种意外突变活了下来，直到第198代才把这种能导致转座子沉默的突变固定。这也是赛格兰致力于果蝇和大鼠世代繁殖的原因。
更有意思的是，鼠爵被特意敲入了裸鼹鼠的大段基因片段，降低了它的dnmt1水平，让它的转座子被异常激活，可以触发协同细胞凋亡，增加干扰素β的产生，触发快速增殖的癌前细胞凋亡，起到抗癌效果。
成也转座，败也转座，生命体真是世界上最复杂的系统，让人捉摸不透。
不过有一点可以肯定，虽然老鼠和人的基因相似度在99%以上，但在转座过程上，它们和我们100%不同。因为逆转录转座子有两种，一种是长末端重复序列（ltr），另一种是非长末端重复序列（non-ltr）。这两种老鼠都有，而人只有non-ltr。
我们和它们不一样。
这并不是什么好事，因为这意味着如果日后想要进行相关研究，所有模板实验动物都用不了，除了猴子和猩猩。实验猴最快也要5-7年才能龟速繁殖一代，直接为这方面的研究宣判死刑。
所以，当卢赫把馒头捡回碗里时，一扫几分钟前的欢喜，再一次陷入恐惧和不安。
人的安全感源自对当下的掌控，和对未来的选择权。他们相信在众多选择中，总会有一种会在未来绽放荣光。
而现在，选择只剩下一个了：
不管那接口有多规范、多强大、多好用、能创造多少奇迹，都不能再留着它。
人与接口不共戴天。
按照日志里的说法，还有4个人的数据仍在传输。
不过目前的这些，已经足够了。
虽然那份日志让人看了之后抑郁到吃不下饭，所谓的“绿疸”病也十分骇人听闻。但在卢赫看来，这些都不重要，毕竟他们的手再长也伸不到一万多公里外的德克萨斯州去。
真正重要的在于那些“绿疸”病人的基因组数据。
一直以来，之所以他们都无法定位导致海老头生病的关键突变，是因为他病得太花里胡哨了。许多病症并没有经过表观学研究，根本没人知道那些莫名其妙的突变对应着什么样的症状。
而日志主人的重病和死亡与“绿疸”绝对相关，“绿疸”又是叶绿素，叶绿素不是人应该拥有的东西，表达它的基因位点很容易定位。
目前所得到的11份数据中有6位健康，5位重病或死亡，这是天然的对照组，他们只要对比叶绿素位点附近的基因段来寻找死亡原因就好了。
海昼天那300多pb的垃圾，不敌莫妮卡的300多gb。还真是可怜。
卢赫感慨着回到办公区，把任务布置下去。几小时后，在场的所有人都开始欢呼着抛馒头。
卢赫也抛了。抛东西是一种释放情绪的方式，可以让人感受到快乐和兴奋。比如婚礼上抛鲜花、运动比赛上抛帽子、节日庆典中抛彩带，这都很正常。无非就是馒头抛完了还要捡回去吃。
人们集体生病的原因找到了。无论是得小病的一般人，还是得大病的海昼天，还是病死了的莫妮卡，原因都在于转座。
九死还魂草没死是因为转座、蓝藻光合作用大幅提高是因为转座、裸鼹鼠长寿不得癌也是因为转座。结局早已写好，线索也数次浮上水面，只是刚刚被有心之人探寻到。
复习一下，转座子是一段不被表达的遗传物质，但却可以被复制和剪切，然后插入到其它基因位点上，调控其它基因的表达。
转座子有两类，一类叫做‘反转座子’，先转录为rna，然后rna再逆转录为dna，插入到特定的位点，是复制粘贴。
另外一类叫做‘dna转座子’，不复制自己，而是直接移位，是剪切粘贴。
这两种都是常见的转座过程。
通过对比“绿疸”病患者的基因发现，相比仍旧健康的患者，重病或死亡的患者存在逆转录转座子的异常激活。那些长达100-5kbp的大剪子，被扰了清梦，格外暴躁地在基因链上胡乱蹿腾，剪开链条，把自己插进去。一旦插到关键的基因片段上，引发致命突变，人就会迅速生病。
至于为什么因转座致病的病人最终可以康复，是因为当突变基因的拷贝量不是很高的时候，细胞在执行新的拷贝时，可以通过同源重组的方式修复异常的基因。只要在这期间，病人还活着。
至于为什么会有转座子异常激活，初步猜测这是生物的一种防护机制。虽然基因突变是物种进化的第一推动力，但绝大多数的基因突变都是不利于生物的生长发育和生存的。
所以生物进化出了多种dna损伤修复机制，包括直接修复、切除修复、重组修复、错配修复等等，防止偶然的dna损伤被转化为永久的突变。
而转座过程修复突变基因是一种完全颠覆性的观点，因为在以往，转座本身就是一种导致基因突变的重要原因之一。但这一次，卢赫他们看到有一部分过分活跃的转座子靶向地出现在了接口和超长外源基因片段上。
它们挥舞着大剪刀狠狠地把这些妖魔鬼怪切开，把自己插入其间，让这些外来的吸血鬼失效，不管它们究竟起了什么作用。家里睡了个陌生人，不论是好人还是坏人，不管三七二十一先嘎了再说。
这本是一套绝妙的防御机制，可也许那些在45亿年间都未曾见过的接口和外源基因过于强大，以至于让它们出现应激反应。
它们不光把陌生人嘎了，顺带着把长得像陌生人的家人也都给嘎了。它们会把自己插入正常的基因片段中，引起不必要的突变，让人生病。
至于为什么有的人不生病，是因为反转座过程可以被多种途径调控，道高一尺魔高一丈，转座子和转座子的监管者始终在进行博弈。
许多因素可以发挥监管作用，比如rna编辑酶apobec家族、na解旋酶mov10、同源重组修复因子brca1等等，它们在历史的长河里，始终与转录转座子共同进化，无时无刻不在进行军备竞赛，谁也不让谁。
更直接的，反转座过程还可以被一种dna甲基转移酶（dnmt1）全局调控，dnmt1水平高的人，转座子会始终处于沉默状态。他们不会触发上述那套离奇的防御机制，也就始终不会因此生病。
至于为什么198号鼠爵及其孩子的基因格外稳定，始终未见类似的过程，初步猜测是因为世代遗传使它们身上发生了选择性清除。
选择性清除指的是，当一个有利突变发生后，这个突变基因的适合度越高，越有利于生存，就越容易被选择固定。
当突变基因被快速固定之后，与此基因座连锁的染色体区域，由于搭车效应也被固定下来，大片紧密连锁的染色体区域因此失去多态性，与突变相冲突的基因会被清除。
这种机制可以完美地解释为什么众多鼠海豚中，只有江豚一种可以在淡水中安然生活。
最初某一群江豚体内与肾功能相关的蛋白基因发生变异，可以在淡水中生存。
之后，淡水中活着的江豚彼此结合，发生选择性清除，与肾功能相关的遗传多样性丧失，繁衍多代后，突变被固定，子代全部可以在淡水中生活。
也许，在赛格兰最初改造的大批老鼠中，只有几只因为各种意外突变活了下来，直到第198代才把这种能导致转座子沉默的突变固定。这也是赛格兰致力于果蝇和大鼠世代繁殖的原因。
更有意思的是，鼠爵被特意敲入了裸鼹鼠的大段基因片段，降低了它的dnmt1水平，让它的转座子被异常激活，可以触发协同细胞凋亡，增加干扰素β的产生，触发快速增殖的癌前细胞凋亡，起到抗癌效果。
成也转座，败也转座，生命体真是世界上最复杂的系统，让人捉摸不透。
不过有一点可以肯定，虽然老鼠和人的基因相似度在99%以上，但在转座过程上，它们和我们100%不同。因为逆转录转座子有两种，一种是长末端重复序列（ltr），另一种是非长末端重复序列（non-ltr）。这两种老鼠都有，而人只有non-ltr。
我们和它们不一样。
这并不是什么好事，因为这意味着如果日后想要进行相关研究，所有模板实验动物都用不了，除了猴子和猩猩。实验猴最快也要5-7年才能龟速繁殖一代，直接为这方面的研究宣判死刑。
所以，当卢赫把馒头捡回碗里时，一扫几分钟前的欢喜，再一次陷入恐惧和不安。
人的安全感源自对当下的掌控，和对未来的选择权。他们相信在众多选择中，总会有一种会在未来绽放荣光。
而现在，选择只剩下一个了：
不管那接口有多规范、多强大、多好用、能创造多少奇迹，都不能再留着它。
人与接口不共戴天。